张謇的很多实业想法都是从农业出发，从很早就开始注意到民族的气象事业发展。他的强烈的爱国主义情怀也让张謇想要创建中国人自己的气象观测系统。最早在中国进行气象观测的是法国人宋君容，俄国东正教会在北京建立过地磁气象台，上海徐家汇观象台当时是由法国天主教会耶稣会控制的［吴增祥.中国近代气象台站］。张謇认为气象观测是国家机密事业，不应由外国人掌控。在光绪三十一年（1905年），张謇在上书清政府要求建立“帝室博览馆”无果之后，在南通创建南通博物苑；光绪三十二年（1906年），在南通博物苑创建测候室，这是第一个由中国人自己创办的测候机构。在通海垦牧公司开垦期间，垦区堤防被海潮冲毁带来巨大损失，让张謇更加重视起农业气象事业的发展。
南通博物苑测候所
南通博物苑建立于光绪三十一年（1905年），是在以大生纱厂盈余筹办的通州师范学校建成后，为了学校师生有实物可参而建。通师校内除师范外还设有测绘科，光绪三十二年（1906年）于博物苑中馆建成测候所。这是最早由国人创办的气象观测所。
在张謇致江知源的手札中可以得知，当时沿海垦区也已建成测候所，并与南通博物苑测候所有业务上的往来。《垦牧手牒》［张謇所建中国第一］
1913年，张謇担任北洋政府农商总长兼水利局总裁，在就任后发表《条议全国水利呈》一文，其中就提到“拟先于各省设观测所，分别综核雨量之多寡，酌派调查员访察今水之情形，一面先从前拟四端，切实筹画，庶有秩序，以利推行。”［张謇全集，公文］。1914年建立部署测候总所，但由于后续经费不足，在此期间建立起的气象事业都逐渐破产。
开设军山气象台进行灾害预报
军山气象台于1914年12月开始建设，1916年竣工。气象台建成后，在张謇的带领下制定了一系列规章制度。气象台的仪器是由上海徐家汇观象台台长田华宝及副台长马徳赉像英、法、德等国订购［军山气象台的发展与贡献］。1917年，气象台开始进行观测工作，主要为气象观测，其次还会对潮汐和天文数据进行观测记录。
清光绪三十一年（1905年）沿海垦区被海潮摧毁时，上海徐家汇观象台曾发过先期警报“飓风将作，从小吕宋来，中心点在海上大七山。上海 、南汇、川沙、崇明、海门、通州沿海地方，正在风圈最紧之内，又值正汛大潮，宜其灾为八九十年所未见。”［张謇全集，公文，p90］张謇一直对气象资料收集颇为重视，也试图以军山气象台之力重获中国东南气象版图，但这个想法后来随着民国政局的不稳定而破产。
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