哲学咨询的价值首先是哲学的价值。哲学作为一门关于智慧的学问、一项爱智的活动、一种反思的思维，虽然往往不直接给人以知识，但却能使人提高理论能力、转变思维方式，甚至提升生命境界。人们关于哲学“无用”的说法也都是说哲学并不如其他学科能够直接应用于生产生活之中并创造财富，却并不否认哲学是“无用而大用”。
但哲学的价值并不直接就是哲学咨询的价值。哲学在历史上几乎从来没有被普及过，而科学和艺术在今天已经广泛、直接、深刻地进入了人们的生活，甚至数学的普及程度也要远好于哲学。哲学越来越学院化、专业化、技术化，脱离了大众，使其价值不能充分实现。哲学咨询就是要在专业的哲学学者和其他人之间构建起一条通道，让哲学的价值在每个人的身上实现。
历史上的哲学家通过各自的哲学理论为人类思考人的问题，但他们的思考替代不了每个人的思考。知识可以拿来就用，但智慧却没有现成的。所以，如果人们不亲身进行哲学的思考，就很难拥有哲学的智慧。而哲学如果只是在少数学者的头脑中被思考的话，它就将变得僵硬、狭隘。所以哲学咨询就体现出了纯粹理论哲学所不具有的价值，那就是能使更多的人进入哲学的思考、拥有成人的智慧、体验精神生活的快乐，同时还能促使理论哲学进行自我反思。
哲学咨询最重要的意义就是让人自己思考。物理学、经济学、政治学等学科都是在替别人思考，这些学科的学者们构建理论并通过系统的技术环节在社会生活中实现出来并直接作用于人们的个人生活中，科学知识、工业产品、经济制度、政治体制都是我们生活的背景，我们不需要参与其中就可以直接利用。但哲学家如果也要替人思考的话，活的理论就要死亡。使用电灯并不需要学习电学，但如果不学习哲学，再高明的哲学理论也只是“存在着的无”。而哲学咨询可以通过“精神助产术”或是哲学史教育等途径让人们进入哲学思考，让自己的头脑为自己思想。
“自己为自己思想”并不局限于个体的自然人，它对于政府、企业和社团甚至全民族都有着深刻的意义。它不像其他资讯行业那样直接治愈心病、打赢官司、制定政策或者设计一套企业文化，而是使人和组织扭转思维习惯、进入哲学思考。这种改变是层次和境界的提升。
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