本组提出我国目前已形成了“指标分类—补充耕地—指标平衡”三阶段的管理链条。而当前制度运行中存在的问题主要在管理的中后程：补充耕地工程建设标准和质量有待进一步提高、指标交易计划及收益使用有待进一步规范、补充耕地弃耕及后期管护缺位有待进一步解决等。由此不难看出我国耕地保护所面临的难题主要集中在管理的中后程，中后程管理的不足与缺失，影响耕地占补平衡实施成效，需要通过全面统筹、系统优化，形成耕地占补平衡管理的完整链条。
对此问题，本组主文章提出了较为系统的解决措施：系统优化顶层设计，转被动式补救为主动式发展；央省分级统筹补充耕地开发，全方位升级补充耕地质量；规范补充耕地指标交易资金用途，推动区域协调发展；完善补充耕地后期管理，建立完善的管护和监督机制。
除此之外，通过分析造成这些问题的原因，不难得出保护耕地是一切问题的出发点的观点。既然如此，从保护耕地的角度出发，我们不仅要保证耕地的量（本组主文章的观点），同时也要确保现存耕地的质。对此，我提出以下四个方面措施：一是科学制定规划，实施统筹协调；二是坚持绿色发展，保护耕地质量；三是实施依法管理，强化责任意识；四是依靠科技创新，解决难点问题。
一是要优化农业耕作模式、注重合理施肥用药，统筹种植养殖结合，既保障重要农产品供给，又促进农业可持续发展。二是要将保护耕地质量与保育土壤健康作为落实粮食安全及食品安全的重要指标，以政府投入为主，带动社会和农民的多元投入，维护健康的土壤。三是要遵循“谁破坏谁治理、谁保护谁受益”的原则，强化耕地质量保护的责任意识。应在动态监测耕地质量基础上，明确乡村农民和经营主体保护土壤健康的责任，以正向措施激励经营主体用好管好良田沃土。四是要应用工程、生物、农机、农艺等集成技术，因地制宜深入探索出一批有效治理与便于应用的模式，因势利导实施推广、集成组装配套应用，把农业发展的动力从外部的大水大肥投入转到依靠自身地力上来，从而实现高产稳产与优质高效。
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